--- type: "WebPage" title: "Laboratoire de séquençage de novo des protéines" description: "En tant qu'industriel vous souhaitez réaliser le séquençage de novo de vos protéines Lorsque les protéines sont inconnues ou peu étudiées, des méthodes classiques d’analyse basées sur des bases de données ne suffisent pas. C'est là qu'intervient le séquençage de..." resource: "https://filab.fr/secteur-activite/laboratoire-analyse-biopharmaceutique/caracterisation-produit-biotherapeutique-proteine-recombinante/sequencage-de-novo-proteines/" tags: ["FR", "pll_6759b9e9ec39c", "Anaïs DECAUX"] timestamp: "2026-03-11T14:22:17Z" published: "2024-12-11T15:59:28Z" language: "fr-FR" author: "Laure Durieux" --- # Laboratoire de séquençage de novo des protéines ## En tant qu'industriel vous souhaitez réaliser le séquençage de novo de vos protéines Lorsque les protéines sont inconnues ou peu étudiées, des méthodes classiques d’analyse basées sur des bases de données ne suffisent pas. C’est là qu’intervient le **séquençage de novo** qui se distingue par sa capacité à déterminer la séquence complète d’une protéine sans recourir à une séquence de référence.  ### Qu’est-ce que le séquençage de Novo des protéines ? Le séquençage de novo est un **test d’identification des protéines.** Il s’agit d’une technique qui reconstruit la séquence d’[acides aminés](https://filab.fr/nos-prestations/analyse/analyses-chimiques/laboratoire-analyse-acides-amines.md) d’une protéine en analysant directement les fragments [peptidiques](https://filab.fr/secteur-activite/laboratoire-analyse-biopharmaceutique/caracterisation-produit-biotherapeutique-proteine-recombinante/analyse-peptidique-lc-ms.md) obtenus par clivage enzymatique. Contrairement aux méthodes classiques qui s’appuient sur des bases de données existantes, cette approche est indépendante et permet de **travailler sur des protéines inconnues**. Cette capacité à explorer l’inconnu fait du séquençage de novo une analyse de protéine particulièrement adaptée pour identifier des protéines issues de matrices complexes, des biomarqueurs ou des produits thérapeutiques en développement. ## Le laboratoire FILAB réalise des analyses sur mesure pour le séquençage de novo et la caractérisation de vos protéines ### Expertise sur les matrices biopharmaceutiques Notre expertise couvre une large gamme de matrices biopharmaceutiques, incluant : - **Solutions formulées et sérums** : pour le séquençage des anticorps monoclonaux et protéines thérapeutiques. - **Milieux de culture cellulaire** : analyse des protéines recombinantes issues de cellules CHO ou autres systèmes d’expression. ## Moyens techniques pour le séquençage de novo [### LC-MS/MS](https://filab.fr/nos-moyens-techniques/laboratoire-analyse-lc-msms.md) [### LC-QTOF](https://filab.fr/nos-moyens-techniques/laboratoire-analyse-lc-qtof.md) [### LC-Orbitrap](https://filab.fr/nos-moyens-techniques/analyse-spectrometrie-masse-orbitrap-laboratoire/) [### Nanopore](https://filab.fr/nos-moyens-techniques/sequencage-nanopore.md) [### Fluorimètre](https://filab.fr/nos-moyens-techniques/analyse-fluorimetre.md) ## Nos prestations Comparer et analyser des séquences de protéines Le séquençage de novo permet de comparer des protéines inconnues à d’autres séquences pour détecter des similarités, des mutations ou des modifications. Cette approche est utile pour : - **Aligner des séquences** : identifier les similitudes entre protéines ou avec des séquences nucléotidiques. - **Étudier l’évolution des protéines** : comprendre leur origine et leur rôle fonctionnel. - **Vérifier les conformités structurelles** : comparer des protéines produites à celles attendues lors du développement biopharmaceutique Le séquençage pour anticorps thérapeutiques FILAB propose des analyses de séquençage de novo pour les anticorps monoclonaux, permettant de : - Vérifier l’intégrité et la conformité des séquences. - Identifier des modifications post-traductionnelles, comme la glycosylation. - Garantir la qualité des produits en cours de développement ou de production. Le séquençage pour protéines recombinantes Nos services incluent le séquençage des [protéines recombinantes](https://filab.fr/secteur-activite/laboratoire-analyse-biopharmaceutique/caracterisation-produit-biotherapeutique-proteine-recombinante-2/) exprimées dans des systèmes comme les cellules CHO. Nous aidons à : - Valider les séquences obtenues après expression recombinante. - Détecter les variations ou contaminants. - Optimiser les étapes de purification et de formulation. Le séquençage pour les biomarqueurs FILAB réalise le séquençage de protéines spécifiques dans des échantillons biologiques pour : - Identifier des biomarqueurs liés à des pathologies. - Comparer les protéines dans des matrices saines et pathologiques. - Faciliter le développement de tests et diagnostics innovants. ![protéines-enzyme-anticoprs](https://filab.fr/wp-content/uploads/2024/08/shutterstock_2494255323-proteines-enzyme-anticoprs.jpg) ### Les étapes du séquençage de novo Le séquençage de novo se déroule en plusieurs phases essentielles : **Clivage enzymatique** : fragmentation des protéines en peptides à l’aide d’enzymes spécifiques, comme la trypsine. **Analyse des peptides par spectrométrie de masse** : détection des fragments peptidiques pour identifier les masses et leurs caractéristiques. **Reconstruction de la séquence** : utilisation d’algorithmes bioinformatiques pour assembler les peptides et prédire la séquence complète de la protéine. Chaque étape est optimisée pour fournir des résultats précis et fiables, même pour les protéines complexes ou inconnues. ## Nos analyses de protéine [Analyse de protéine](https://filab.fr/secteur-activite/laboratoire-analyse-biopharmaceutique/caracterisation-produit-biotherapeutique-proteine-recombinante/analyse-proteines.md) [Analyse protéine recombinante](https://filab.fr/secteur-activite/laboratoire-analyse-biopharmaceutique/caracterisation-produit-biotherapeutique-proteine-recombinante-2/) [Analyse glycoprotéine](https://filab.fr/secteur-activite/laboratoire-analyse-biopharmaceutique/caracterisation-produit-biotherapeutique-proteine-recombinante/analyse-caracterisation-glycoproteine.md) [Formation ICH Q6B](https://filab.fr/nos-prestations/accompagnement-rd/formation/formation-ich-q6b.md) ## Applications du séquençage de novo dans l’industrie biopharmaceutique Le séquençage de novo trouve des applications clés dans divers domaines industriels et scientifiques : Développement de biomédicaments - Identification et caractérisation de protéines thérapeutiques - Étude des anticorps monoclonaux - Vérification de la structure primaire des protéines recombinantes - **Découverte de nouvelles protéines** :  permet d’identifier des protéines inconnues, souvent présentes dans des matrices complexes, et contribue ainsi à la recherche fondamentale ou à l’innovation biopharmaceutique. Analyse de contaminants protéiques - Détection de **protéines exogènes** ou **impuretés** dans les bioprocédés - Identification de contaminants dans les lots de production Contrôle qualité et réglementation - Confirmation de la **structure primaire des protéines** - Contrôle de l’intégrité des biothérapies - **Analyse des modifications post-traductionnelles** : cette méthode identifie des variations structurelles, comme les phosphorylations ou glycosylations, non répertoriées dans les bases de données. - **Études sur des protéines complexes** : idéal pour l’analyse de mélanges protéiques issus de matrices biologiques ou environnementales, où les séquences classiques ne suffisent pas. Ces applications montrent l’importance de cette analyse dans la découverte de biomarqueurs ou le [développement de biomédicaments](https://filab.fr/secteur-activite/laboratoire-analyse-biopharmaceutique/caracterisation-produit-biotherapeutique-proteine-recombinante/analyse-caracterisation-biosimilaires.md).  ### Pourquoi réaliser un séquençage de novo en laboratoire ? Le séquençage de novo est utilisé par le laboratoire FILAB pour identifier et [caractériser des protéines](https://filab.fr/secteur-activite/laboratoire-analyse-biopharmaceutique/caracterisation-produit-biotherapeutique-proteine-recombinante.md) inconnues ou non répertoriées. Cette méthode permet : **Caractériser des protéines inconnues** : identifier des séquences non référencées, essentielles pour la découverte de nouvelles molécules. **Optimiser les [biomédicaments](https://filab.fr/nos-prestations/analyse/laboratoire-dosage-nitrosamine/laboratoire-analyse-biomedicament.md)** : comprendre les variations dans les protéines thérapeutiques et améliorer leur formulation. **Analyser les modifications post-traductionnelles** : détecter des modifications structurelles importantes pour la fonction ou l’efficacité des protéines. **Explorer les biomarqueurs** : identifier des protéines spécifiques dans des échantillons biologiques pour des applications diagnostiques ou de recherche. ## FAQ Pourquoi réaliser un séquençage de novo sur des protéines issues de sérums ou solutions formulées ? Le séquençage de novo permet de vérifier l’intégrité et la séquence des protéines présentes dans les sérums ou solutions formulées, comme les anticorps monoclonaux. Cela garantit leur conformité aux spécifications thérapeutiques et détecte d’éventuelles modifications structurelles ou impuretés. Quels sont les avantages du séquençage de novo pour les protéines recombinantes dans les milieux de culture ? Pour les protéines recombinantes, le séquençage de novo identifie précisément la séquence obtenue après expression dans des milieux de culture cellulaire. Il permet également de détecter des variations post-traductionnelles et de vérifier l’absence de contaminants, optimisant ainsi les processus de purification et de production. Quel est l’intérêt du séquençage avancé des protéines pour la biopharmacie ? Le **séquençage de novo des protéines** est un outil clé pour la **biopharmacie**, permettant d’identifier et de caractériser des **protéines thérapeutiques** sans recourir à une base de données existante. Cette approche est essentielle pour **valider l’intégrité structurale des biomédicaments**, optimiser le développement de nouvelles molécules et garantir la conformité des produits aux réglementations en vigueur (EMA, FDA). Pourquoi réaliser une caractérisation structurale des protéines sans référence ? La **caractérisation structurale des protéines sans référence** repose sur le **séquençage de novo**, qui permet d’analyser la structure primaire d’une protéine inconnue ou modifiée. Cette méthode est particulièrement utile pour **détecter des variants, identifier des impuretés protéiques et contrôler la pureté des bioproduits**, notamment dans les processus de bioproduction et de formulation de biomédicaments. En quoi le décryptage de la structure primaire des biomolécules est-il lié au séquençage de novo ? Le **décryptage de la structure primaire des biomolécules** est une étape clé du **séquençage de novo des protéines**, permettant de **déterminer la séquence exacte des peptides** et de mettre en évidence d’éventuelles **modifications post-traductionnelles**. Cette analyse est cruciale pour **optimiser la stabilité des protéines thérapeutiques**, assurer la reproductibilité des lots de production et garantir l’efficacité des traitements biopharmaceutiques. Pourquoi la spectrométrie de masse en tandem (MS/MS) est-elle essentielle en biopharmacie ? La **spectrométrie de masse en tandem (MS/MS)** est indispensable pour **identifier des protéines inconnues, contrôler la pureté des biomédicaments et détecter des contaminants**. En fragmentant les peptides, elle permet un **séquençage précis sans base de données**, assurant la conformité et la traçabilité des produits biopharmaceutiques. Confier cette analyse à un laboratoire garantit fiabilité et respect des normes réglementaires. Pourquoi choisir le séquençage de novo plutôt que le peptide fingerprinting en bioproduction ? Le **séquençage de novo** est essentiel pour **caractériser des protéines non répertoriées et analyser des variants**, contrairement au **peptide fingerprinting**, qui se limite aux bases de données existantes. Pour les industriels, cette approche permet un **contrôle qualité plus poussé**, réduisant les risques et assurant la conformité des biomédicaments. Un laboratoire expert offre **précision, équipements de pointe et accompagnement réglementaire**. Quelles sont les avantages du séquençage de novo ? Le séquençage de novo présente des atouts majeurs qui le différencient des approches classiques : - **Indépendance des bases de données** : idéal pour explorer des protéines inédites ou peu étudiées. - **Identification précise des variantes** : détection des modifications structurelles non prévues ou non documentées. - **Adaptabilité aux matrices complexes** : analyse efficace dans des échantillons complexes ou peu purifiés. Ces avantages en font une méthode incontournable pour les projets d’innovation en biopharmaceutique et en recherche biomédicale.