Als Industrieunternehmen möchten Sie die De-novo-Sequenzierung Ihrer Proteine durchführen lassen
Wenn Proteine unbekannt oder wenig untersucht sind, reichen klassische, datenbankgestützte Analyseverfahren nicht aus. Hier kommt die De-novo-Sequenzierung ins Spiel, die sich durch ihre Fähigkeit auszeichnet, die vollständige Sequenz eines Proteins ohne Rückgriff auf eine Referenzsequenz zu bestimmen.
Was ist die De-novo-Sequenzierung von Proteinen?
Die De-novo-Sequenzierung ist ein Proteinidentifikationstest. Dabei handelt es sich um eine Technik, die die Aminosäure-Sequenz eines Proteins rekonstruiert, indem direkt die durch enzymatische Spaltung gewonnenen Peptid-Fragmente analysiert werden.
Im Gegensatz zu klassischen Methoden, die auf vorhandenen Datenbanken basieren, ist dieser Ansatz unabhängig und ermöglicht es, mit unbekannten Proteinen zu arbeiten.
Diese Fähigkeit, das Unbekannte zu erschließen, macht die De-novo-Sequenzierung zu einer besonders geeigneten Proteinanalyse, um Proteine aus komplexen Matrizes, Biomarker oder in Entwicklung befindliche therapeutische Produkte zu identifizieren.
Das Labor FILAB führt maßgeschneiderte Analysen für die De-novo-Sequenzierung und Charakterisierung Ihrer Proteine durch
Expertise für biopharmazeutische Matrizes
Unsere Expertise umfasst eine breite Palette biopharmazeutischer Matrizes, darunter:
- Formulierte Lösungen und Seren : für die Sequenzierung monoklonaler Antikörper und therapeutischer Proteine.
- Zellkulturmedien : Analyse rekombinanter Proteine aus CHO-Zellen oder anderen Expressionssystemen.
Unsere Leistungen
Die De-novo-Sequenzierung ermöglicht den Vergleich unbekannter Proteine mit anderen Sequenzen, um Ähnlichkeiten, Mutationen oder Modifikationen zu erkennen. Dieser Ansatz ist nützlich für:
- Sequenzen abgleichen : Ähnlichkeiten zwischen Proteinen oder mit Nukleotidsequenzen identifizieren.
- Die Evolution von Proteinen untersuchen : ihre Herkunft und ihre funktionelle Rolle verstehen.
- Strukturelle Übereinstimmungen überprüfen : hergestellte Proteine mit den im biopharmazeutischen Entwicklungsprozess erwarteten vergleichen
FILAB bietet De-novo-Sequenzierungsanalysen für monoklonale Antikörper an, um:
- die Integrität und Konformität der Sequenzen zu überprüfen.
- posttranslationale Modifikationen wie die Glykosylierung zu identifizieren.
- die Qualität von Produkten in Entwicklung oder Produktion sicherzustellen.
Unsere Dienstleistungen umfassen die Sequenzierung von rekombinanten Proteinen, die in Systemen wie CHO-Zellen exprimiert werden. Wir unterstützen Sie bei:
- der Validierung der nach rekombinanter Expression erhaltenen Sequenzen.
- dem Nachweis von Variationen oder Kontaminanten.
- der Optimierung von Reinigungs- und Formulierungsschritten.
FILAB führt die Sequenzierung spezifischer Proteine in biologischen Proben durch, um:
- Biomarker im Zusammenhang mit Pathologien zu identifizieren.
- Proteine in gesunden und pathologischen Matrizes zu vergleichen.
- die Entwicklung innovativer Tests und Diagnostikverfahren zu erleichtern.
Die Schritte der De-novo-Sequenzierung
Die De-novo-Sequenzierung erfolgt in mehreren wesentlichen Phasen:
Jeder Schritt wird optimiert, um präzise und zuverlässige Ergebnisse zu liefern, selbst bei komplexen oder unbekannten Proteinen.
Unsere Proteinanalysen
Anwendungen der De-novo-Sequenzierung in der biopharmazeutischen Industrie
Die De-novo-Sequenzierung findet in verschiedenen industriellen und wissenschaftlichen Bereichen wichtige Anwendungen:
- Identifizierung und Charakterisierung therapeutischer Proteine
- Untersuchung monoklonaler Antikörper
- Überprüfung der Primärstruktur rekombinanter Proteine
- Entdeckung neuer Proteine : ermöglicht die Identifizierung unbekannter Proteine, die häufig in komplexen Matrizes vorkommen, und trägt so zur Grundlagenforschung oder biopharmazeutischen Innovation bei.
- Nachweis von fremden Proteinen oder Verunreinigungen in Bioprozessen
- Identifizierung von Kontaminanten in Produktionschargen
- Bestätigung der Primärstruktur von Proteinen
- Integritätskontrolle von Biotherapeutika
- Analyse posttranslationaler Modifikationen : diese Methode identifiziert strukturelle Variationen wie Phosphorylierungen oder Glykosylierungen, die in Datenbanken nicht erfasst sind.
- Untersuchungen an komplexen Proteinen : ideal für die Analyse von Proteinmischungen aus biologischen oder umweltbezogenen Matrizes, bei denen klassische Sequenzen nicht ausreichen.
Diese Anwendungen zeigen die Bedeutung dieser Analyse bei der Entdeckung von Biomarkern oder der Entwicklung von Biopharmazeutika.
Warum eine De-novo-Sequenzierung im Labor durchführen?
Die De-novo-Sequenzierung wird im FILAB-Labor eingesetzt, um unbekannte oder nicht erfasste Proteine zu identifizieren und zu charakterisieren. Diese Methode ermöglicht:
Unbekannte Proteine charakterisieren : nicht referenzierte Sequenzen identifizieren, die für die Entdeckung neuer Moleküle entscheidend sind.
Posttranslationale Modifikationen analysieren : wichtige strukturelle Veränderungen erkennen, die die Funktion oder Wirksamkeit von Proteinen beeinflussen.
Biomarker erforschen : spezifische Proteine in biologischen Proben für diagnostische oder Forschungsanwendungen identifizieren.
FAQ
Die De-novo-Sequenzierung ermöglicht es, die Integrität und die Sequenz von Proteinen in Seren oder formulierten Lösungen, wie monoklonalen Antikörpern, zu überprüfen. So wird ihre Übereinstimmung mit den therapeutischen Spezifikationen sichergestellt und mögliche strukturelle Veränderungen oder Verunreinigungen werden erkannt.
Bei rekombinanten Proteinen identifiziert die De-novo-Sequenzierung präzise die Sequenz, die nach der Expression in Zellkulturmedien entsteht. Sie ermöglicht außerdem den Nachweis posttranslationaler Variationen und die Überprüfung auf das Fehlen von Kontaminanten, wodurch die Reinigungs- und Produktionsprozesse optimiert werden.
Die De-novo-Sequenzierung von Proteinen ist ein zentrales Werkzeug für die Biopharmazie, da sie die Identifizierung und Charakterisierung von therapeutischen Proteinen ohne Rückgriff auf eine bestehende Datenbank ermöglicht. Dieser Ansatz ist entscheidend, um die strukturelle Integrität von Biopharmazeutika zu validieren, die Entwicklung neuer Moleküle zu optimieren und die Konformität der Produkte mit den geltenden Vorschriften (EMA, FDA) sicherzustellen.
Die strukturelle Charakterisierung von Proteinen ohne Referenz basiert auf der De-novo-Sequenzierung, die es ermöglicht, die Primärstruktur eines unbekannten oder modifizierten Proteins zu analysieren. Diese Methode ist besonders nützlich, um Varianten nachzuweisen, Proteinverunreinigungen zu identifizieren und die Reinheit von Bioprodukten zu kontrollieren, insbesondere in den Prozessen der Bioproduktion und der Formulierung von Biopharmazeutika.
Die Entschlüsselung der Primärstruktur von Biomolekülen ist ein zentraler Schritt der De-novo-Sequenzierung von Proteinen, da sie es ermöglicht, die exakte Peptidsequenz zu bestimmen und mögliche posttranslationale Modifikationen sichtbar zu machen. Diese Analyse ist entscheidend, um die Stabilität therapeutischer Proteine zu optimieren, die Reproduzierbarkeit der Produktionschargen sicherzustellen und die Wirksamkeit biopharmazeutischer Behandlungen zu gewährleisten.
Die Tandem-Massenspektrometrie (MS/MS) ist unverzichtbar, um unbekannte Proteine zu identifizieren, die Reinheit von Biopharmazeutika zu kontrollieren und Kontaminanten nachzuweisen. Durch die Fragmentierung der Peptide ermöglicht sie eine präzise Sequenzierung ohne Datenbank und gewährleistet so die Konformität und Rückverfolgbarkeit biopharmazeutischer Produkte. Die Beauftragung eines Labors für diese Analyse garantiert Zuverlässigkeit und die Einhaltung regulatorischer Standards.
Die De-novo-Sequenzierung ist unerlässlich, um nicht gelistete Proteine zu charakterisieren und Varianten zu analysieren, im Gegensatz zum Peptid-Fingerprinting, das sich auf bestehende Datenbanken beschränkt. Für Industrieunternehmen ermöglicht dieser Ansatz eine umfassendere Qualitätskontrolle, reduziert Risiken und stellt die Konformität von Biopharmazeutika sicher. Ein Expertlabor bietet Präzision, modernste Ausrüstung und regulatorische Begleitung.
Die De-novo-Sequenzierung bietet wesentliche Vorteile, die sie von klassischen Ansätzen unterscheiden:
- Unabhängigkeit von Datenbanken : ideal, um neuartige oder wenig untersuchte Proteine zu erforschen.
- Präzise Identifizierung von Varianten : Erkennung unerwarteter oder nicht dokumentierter struktureller Modifikationen.
- Anpassungsfähigkeit an komplexe Matrizes : effiziente Analyse in komplexen oder wenig gereinigten Proben.
Diese Vorteile machen sie zu einer unverzichtbaren Methode für Innovationsprojekte in der Biopharmazeutik und der biomedizinischen Forschung.
