Como industrial, desea realizar la secuenciación de novo de sus proteínas
Cuando las proteínas son desconocidas o poco estudiadas, los métodos clásicos de análisis basados en bases de datos no son suficientes. Ahí es donde interviene la secuenciación de novo, que destaca por su capacidad para determinar la secuencia completa de una proteína sin recurrir a una secuencia de referencia.
¿Qué es la secuenciación de novo de proteínas?
La secuenciación de novo es una prueba de identificación de proteínas. Se trata de una técnica que reconstruye la secuencia de aminoácidos de una proteína analizando directamente los fragmentos peptídicos obtenidos por clivaje enzimático.
A diferencia de los métodos clásicos que se apoyan en bases de datos existentes, este enfoque es independiente y permite trabajar con proteínas desconocidas.
Esta capacidad para explorar lo desconocido convierte la secuenciación de novo en un análisis de proteínas especialmente adecuado para identificar proteínas procedentes de matrices complejas, biomarcadores o productos terapéuticos en desarrollo.
El laboratorio FILAB realiza análisis a medida para la secuenciación de novo y la caracterización de sus proteínas
Experiencia en matrices biofarmacéuticas
Nuestra experiencia abarca una amplia gama de matrices biopharma, entre ellas:
- Soluciones formuladas y sueros : para la secuenciación de anticuerpos monoclonales y proteínas terapéuticas.
- Medios de cultivo celular : análisis de proteínas recombinantes procedentes de células CHO u otros sistemas de expresión.
Nuestros servicios
La secuenciación de novo permite comparar proteínas desconocidas con otras secuencias para detectar similitudes, mutaciones o modificaciones. Este enfoque es útil para:
- Alinear secuencias : identificar similitudes entre proteínas o con secuencias nucleotídicas.
- Estudiar la evolución de las proteínas : comprender su origen y su función biológica.
- Verificar las conformidades estructurales : comparar proteínas producidas con las esperadas durante el desarrollo biofarmacéutico
FILAB ofrece análisis de secuenciación de novo para anticuerpos monoclonales, que permiten:
- Verificar la integridad y la conformidad de las secuencias.
- Identificar modificaciones postraduccionales, como la glicosilación.
- Garantizar la calidad de los productos en desarrollo o en producción.
Nuestros servicios incluyen la secuenciación de proteínas recombinantes expresadas en sistemas como las células CHO. Ayudamos a:
- Validar las secuencias obtenidas tras la expresión recombinante.
- Detectar variaciones o contaminantes.
- Optimizar las etapas de purificación y formulación.
FILAB realiza la secuenciación de proteínas específicas en muestras biológicas para:
- Identificar biomarcadores relacionados con patologías.
- Comparar las proteínas en matrices sanas y patológicas.
- Facilitar el desarrollo de pruebas y diagnósticos innovadores.
Las etapas de la secuenciación de novo
La secuenciación de novo se desarrolla en varias fases esenciales:
Cada etapa se optimiza para ofrecer resultados precisos y fiables, incluso para proteínas complejas o desconocidas.
Nuestros análisis de proteínas
Aplicaciones de la secuenciación de novo en la industria biofarmacéutica
La secuenciación de novo encuentra aplicaciones clave en diversos ámbitos industriales y científicos:
- Identificación y caracterización de proteínas terapéuticas
- Estudio de anticuerpos monoclonales
- Verificación de la estructura primaria de las proteínas recombinantes
- Descubrimiento de nuevas proteínas : permite identificar proteínas desconocidas, a menudo presentes en matrices complejas, y contribuye así a la investigación fundamental o a la innovación biofarmacéutica.
- Detección de proteínas exógenas o impurezas en los bioprocesos
- Identificación de contaminantes en los lotes de producción
- Confirmación de la estructura primaria de las proteínas
- Control de la integridad de las bioterapias
- Análisis de las modificaciones postraduccionales : este método identifica variaciones estructurales, como fosforilaciones o glicosilaciones, no registradas en las bases de datos.
- Estudios sobre proteínas complejas : ideal para el análisis de mezclas proteicas procedentes de matrices biológicas o ambientales, donde las secuencias clásicas no son suficientes.
Estas aplicaciones muestran la importancia de este análisis en el descubrimiento de biomarcadores o el desarrollo de biomedicamentos.
¿Por qué realizar una secuenciación de novo en el laboratorio?
La secuenciación de novo es utilizada por el laboratorio FILAB para identificar y caracterizar proteínas desconocidas o no registradas. Este método permite:
Caracterizar proteínas desconocidas : identificar secuencias no referenciadas, esenciales para el descubrimiento de nuevas moléculas.
Optimizar los biomedicamentos : comprender las variaciones en las proteínas terapéuticas y mejorar su formulación.
Analizar las modificaciones postraduccionales : detectar modificaciones estructurales importantes para la función o la eficacia de las proteínas.
Explorar los biomarcadores : identificar proteínas específicas en muestras biológicas para aplicaciones diagnósticas o de investigación.
FAQ
La secuenciación de novo permite verificar la integridad y la secuencia de las proteínas presentes en los sueros o soluciones formuladas, como los anticuerpos monoclonales. Esto garantiza su conformidad con las especificaciones terapéuticas y detecta posibles modificaciones estructurales o impurezas.
Para las proteínas recombinantes, la secuenciación de novo identifica con precisión la secuencia obtenida tras la expresión en medios de cultivo celular. También permite detectar variaciones postraduccionales y verificar la ausencia de contaminantes, optimizando así los procesos de purificación y producción.
La secuenciación de novo de proteínas es una herramienta clave para la biopharmacia, que permite identificar y caracterizar proteínas terapéuticas sin recurrir a una base de datos existente. Este enfoque es esencial para validar la integridad estructural de los biomedicamentos, optimizar el desarrollo de nuevas moléculas y garantizar la conformidad de los productos con la normativa vigente (EMA, FDA).
La caracterización estructural de proteínas sin referencia se basa en la secuenciación de novo, que permite analizar la estructura primaria de una proteína desconocida o modificada. Este método es especialmente útil para detectar variantes, identificar impurezas proteicas y controlar la pureza de los bioproductos, especialmente en los procesos de bioproducción y formulación de biomedicamentos.
La descodificación de la estructura primaria de las biomoléculas es una etapa clave de la secuenciación de novo de proteínas, que permite determinar la secuencia exacta de los péptidos y poner de relieve posibles modificaciones postraduccionales. Este análisis es crucial para optimizar la estabilidad de las proteínas terapéuticas, asegurar la reproducibilidad de los lotes de producción y garantizar la eficacia de los tratamientos biofarmacéuticos.
La espectrometría de masas en tándem (MS/MS) es indispensable para identificar proteínas desconocidas, controlar la pureza de los biomedicamentos y detectar contaminantes. Al fragmentar los péptidos, permite una secuenciación precisa sin base de datos, garantizando la conformidad y la trazabilidad de los productos biofarmacéuticos. Confiar este análisis a un laboratorio garantiza fiabilidad y cumplimiento de las normas regulatorias.
La secuenciación de novo es esencial para caracterizar proteínas no registradas y analizar variantes, a diferencia del peptide fingerprinting, que se limita a las bases de datos existentes. Para los industriales, este enfoque permite un control de calidad más exhaustivo, reduciendo los riesgos y garantizando la conformidad de los biomedicamentos. Un laboratorio experto ofrece precisión, equipos de vanguardia y acompañamiento regulatorio.
La secuenciación de novo presenta ventajas clave que la diferencian de los enfoques clásicos:
- Independencia de las bases de datos : ideal para explorar proteínas inéditas o poco estudiadas.
- Identificación precisa de variantes : detección de modificaciones estructurales no previstas o no documentadas.
- Adaptabilidad a matrices complejas : análisis eficaz en muestras complejas o poco purificadas.
Estas ventajas la convierten en un método imprescindible para los proyectos de innovación en biopharmaceutique y en investigación biomédica.
