In qualità di azienda industriale, desiderate effettuare il sequenziamento de novo delle vostre proteine
Quando le proteine sono sconosciute o poco studiate, i metodi classici di analisi basati su database non sono sufficienti. È qui che entra in gioco il sequenziamento de novo, che si distingue per la sua capacità di determinare la sequenza completa di una proteina senza ricorrere a una sequenza di riferimento.
Che cos’è il sequenziamento de novo delle proteine?
Il sequenziamento de novo è un test di identificazione delle proteine. Si tratta di una tecnica che ricostruisce la sequenza di amminoacidi di una proteina analizzando direttamente i frammenti peptidici ottenuti per clivaggio enzimatico.
A differenza dei metodi classici che si basano su database esistenti, questo approccio è indipendente e consente di lavorare su proteine sconosciute.
Questa capacità di esplorare l’ignoto rende il sequenziamento de novo un’analisi proteica particolarmente adatta a identificare proteine provenienti da matrici complesse, biomarcatori o prodotti terapeutici in sviluppo.
Il laboratorio FILAB esegue analisi su misura per il sequenziamento de novo e la caratterizzazione delle vostre proteine
Competenza sulle matrici biofarmaceutiche
La nostra competenza copre un’ampia gamma di matrici biopharma, tra cui:
- Soluzioni formulate e sieri : per il sequenziamento di anticorpi monoclonali e proteine terapeutiche.
- Mezzi di coltura cellulare : analisi di proteine ricombinanti provenienti da cellule CHO o da altri sistemi di espressione.
I nostri servizi
Il sequenziamento de novo consente di confrontare proteine sconosciute con altre sequenze per rilevare somiglianze, mutazioni o modifiche. Questo approccio è utile per:
- Allineare le sequenze : identificare le somiglianze tra proteine o con sequenze nucleotidiche.
- Studiare l’evoluzione delle proteine : comprenderne l’origine e il ruolo funzionale.
- Verificare la conformità strutturale : confrontare le proteine prodotte con quelle attese durante lo sviluppo biofarmaceutico
FILAB propone analisi di sequenziamento de novo per anticorpi monoclonali, consentendo di:
- Verificare l’integrità e la conformità delle sequenze.
- Identificare modifiche post-traduzionali, come la glicosilazione.
- Garantire la qualità dei prodotti in fase di sviluppo o di produzione.
I nostri servizi includono il sequenziamento delle proteine ricombinanti espresse in sistemi come le cellule CHO. Aiutiamo a:
- Convalidare le sequenze ottenute dopo l’espressione ricombinante.
- Rilevare variazioni o contaminanti.
- Ottimizzare le fasi di purificazione e formulazione.
FILAB esegue il sequenziamento di proteine specifiche in campioni biologici per:
- Identificare biomarcatori legati a patologie.
- Confrontare le proteine in matrici sane e patologiche.
- Facilitare lo sviluppo di test e diagnostiche innovative.
Le fasi del sequenziamento de novo
Il sequenziamento de novo si svolge in diverse fasi essenziali:
Ogni fase è ottimizzata per fornire risultati precisi e affidabili, anche per proteine complesse o sconosciute.
Le nostre analisi proteiche
Applicazioni del sequenziamento de novo nell’industria biofarmaceutica
Il sequenziamento de novo trova applicazioni chiave in diversi ambiti industriali e scientifici:
- Identificazione e caratterizzazione di proteine terapeutiche
- Studio degli anticorpi monoclonali
- Verifica della struttura primaria delle proteine ricombinanti
- Scoperta di nuove proteine : consente di identificare proteine sconosciute, spesso presenti in matrici complesse, e contribuisce così alla ricerca di base o all’innovazione biofarmaceutica.
- Rilevazione di proteine esogene o impurità nei bioprocessi
- Identificazione di contaminanti nei lotti di produzione
- Conferma della struttura primaria delle proteine
- Controllo dell’integrità delle bioterapie
- Analisi delle modifiche post-traduzionali : questo metodo identifica variazioni strutturali, come fosforilazioni o glicosilazioni, non riportate nei database.
- Studi su proteine complesse : ideale per l’analisi di miscele proteiche provenienti da matrici biologiche o ambientali, dove i sequenziamenti classici non sono sufficienti.
Queste applicazioni mostrano l’importanza di questa analisi nella scoperta di biomarcatori o nello sviluppo di biomedicinali.
Perché eseguire un sequenziamento de novo in laboratorio?
Il sequenziamento de novo è utilizzato dal laboratorio FILAB per identificare e caratterizzare proteine sconosciute o non catalogate. Questo metodo consente:
Caratterizzare proteine sconosciute : identificare sequenze non referenziate, essenziali per la scoperta di nuove molecole.
Ottimizzare i biomedicinali : comprendere le variazioni nelle proteine terapeutiche e migliorarne la formulazione.
Analizzare le modifiche post-traduzionali : rilevare modifiche strutturali importanti per la funzione o l’efficacia delle proteine.
Esplorare i biomarcatori : identificare proteine specifiche in campioni biologici per applicazioni diagnostiche o di ricerca.
FAQ
Il sequenziamento de novo consente di verificare l’integrità e la sequenza delle proteine presenti nei sieri o nelle soluzioni formulate, come gli anticorpi monoclonali. Ciò garantisce la loro conformità alle specifiche terapeutiche e rileva eventuali modifiche strutturali o impurità.
Per le proteine ricombinanti, il sequenziamento de novo identifica con precisione la sequenza ottenuta dopo l’espressione nei mezzi di coltura cellulare. Consente inoltre di rilevare variazioni post-traduzionali e di verificare l’assenza di contaminanti, ottimizzando così i processi di purificazione e produzione.
Il sequenziamento de novo delle proteine è uno strumento chiave per la biofarmaceutica, che consente di identificare e caratterizzare proteine terapeutiche senza ricorrere a un database esistente. Questo approccio è essenziale per validare l’integrità strutturale dei biomedicinali, ottimizzare lo sviluppo di nuove molecole e garantire la conformità dei prodotti alle normative vigenti (EMA, FDA).
La caratterizzazione strutturale delle proteine senza riferimento si basa sul sequenziamento de novo, che consente di analizzare la struttura primaria di una proteina sconosciuta o modificata. Questo metodo è particolarmente utile per rilevare varianti, identificare impurità proteiche e controllare la purezza dei bioprodotti, in particolare nei processi di bioproduzione e formulazione di biomedicinali.
La decodifica della struttura primaria delle biomolecole è una fase chiave del sequenziamento de novo delle proteine, che consente di determinare la sequenza esatta dei peptidi e di mettere in evidenza eventuali modifiche post-traduzionali. Questa analisi è fondamentale per ottimizzare la stabilità delle proteine terapeutiche, garantire la riproducibilità dei lotti di produzione e assicurare l’efficacia dei trattamenti biofarmaceutici.
La spettrometria di massa tandem (MS/MS) è indispensabile per identificare proteine sconosciute, controllare la purezza dei biomedicinali e rilevare contaminanti. Frammentando i peptidi, consente un sequenziamento preciso senza database, garantendo la conformità e la tracciabilità dei prodotti biofarmaceutici. Affidare questa analisi a un laboratorio garantisce affidabilità e rispetto delle norme regolatorie.
Il sequenziamento de novo è essenziale per caratterizzare proteine non catalogate e analizzare varianti, a differenza del peptide fingerprinting, che si limita ai database esistenti. Per le aziende, questo approccio consente un controllo qualità più approfondito, riducendo i rischi e garantendo la conformità dei biomedicinali. Un laboratorio esperto offre precisione, apparecchiature all’avanguardia e supporto regolatorio.
Il sequenziamento de novo presenta vantaggi significativi che lo distinguono dagli approcci classici:
- Indipendenza dai database : ideale per esplorare proteine inedite o poco studiate.
- Identificazione precisa delle varianti : rilevamento di modifiche strutturali non previste o non documentate.
- Adattabilità a matrici complesse : analisi efficace in campioni complessi o poco purificati.
Questi vantaggi ne fanno un metodo imprescindibile per i progetti di innovazione in biopharmaceutica e nella ricerca biomedica.
