En tant qu'industriel vous souhaitez réaliser le séquençage de novo de vos protéines
Dans l’industrie biopharmaceutique, comprendre la structure et les propriétés des protéines est essentiel pour innover, garantir la qualité et répondre aux exigences réglementaires. Cependant, lorsque les protéines sont inconnues ou peu étudiées, des méthodes classiques d’analyse basées sur des bases de données ne suffisent pas. Le séquençage de novo se distingue par sa capacité à déterminer la séquence complète d’une protéine sans recourir à une séquence de référence.
Qu’est-ce que le séquençage de Novo des protéines ?
Le séquençage de novo test d’identification des protéines. Il s’agit d’ est une technique qui reconstruit la séquence d’acides aminés d’une protéine en analysant directement les fragments peptidiques obtenus par clivage enzymatique. Contrairement aux méthodes classiques qui s’appuient sur des bases de données existantes, cette approche est indépendante et permet de travailler sur des protéines inconnues.
Cette capacité à explorer l’inconnu fait du séquençage de novo une analyse de protéine particulièrement adaptée pour identifier des protéines issues de matrices complexes, des biomarqueurs ou des produits thérapeutiques en développement.
Les étapes du séquençage de novo
Le séquençage de novo se déroule en plusieurs phases essentielles :
Chaque étape est optimisée pour fournir des résultats précis et fiables, même pour les protéines complexes ou inconnues.
Pourquoi réaliser un séquençage de novo en laboratoire ?
Le séquençage de novo est utilisé par le laboratoire FILAB pour identifier et caractériser des protéines inconnues ou non répertoriées. Cette méthode permet :
Caractériser des protéines inconnues : identifier des séquences non référencées, essentielles pour la découverte de nouvelles molécules.
Optimiser les biomédicaments : comprendre les variations dans les protéines thérapeutiques et améliorer leur formulation.
Analyser les modifications post-traductionnelles : détecter des modifications structurelles importantes pour la fonction ou l’efficacité des protéines.
Explorer les biomarqueurs : identifier des protéines spécifiques dans des échantillons biologiques pour des applications diagnostiques ou de recherche.
Le laboratoire FILAB réalise des analyses sur mesure pour le séquençage de novo et la caractérisation de vos protéines
Expertise sur les matrices biopharmaceutiques
Notre expertise couvre une large gamme de matrices biopharmaceutiques, incluant :
- Solutions formulées et sérums : pour le séquençage des anticorps monoclonaux et protéines thérapeutiques.
- Milieux de culture cellulaire : analyse des protéines recombinantes issues de cellules CHO ou autres systèmes d’expression.
Moyens techniques pour le séquençage de novo
Notre expertise en spectrométrie de masse pour le séquençage de novo
Le laboratoire FILAB s’appuie sur des technologies de pointe en spectrométrie de masse (MS/MS) pour analyser et reconstruire la séquence peptidique des protéines. Cette approche repose sur plusieurs étapes clés :
Permet d’obtenir un spectre précis des peptides pour analyser la structure des protéines et détecter d’éventuelles anomalies.
Assure la reconstruction fiable de la séquence peptidique, garantissant l’intégrité et la conformité des biomolécules.
- Contrairement au peptide mass fingerprinting, qui compare les données à des bases existantes, le séquençage de novo permet de caractériser des protéines inconnues, contrôler la pureté des bioproduits et identifier d’éventuels contaminants.
Nos analyses offrent une précision optimale pour l’identification de protéines nouvelles, modifiées ou complexes, avec une grande sensibilité.
Nos prestations
Le séquençage de novo permet de comparer des protéines inconnues à d’autres séquences pour détecter des similarités, des mutations ou des modifications. Cette approche est utile pour :
- Aligner des séquences : identifier les similitudes entre protéines ou avec des séquences nucléotidiques.
- Étudier l’évolution des protéines : comprendre leur origine et leur rôle fonctionnel.
- Vérifier les conformités structurelles : comparer des protéines produites à celles attendues lors du développement biopharmaceutique
FILAB propose des analyses de séquençage de novo pour les anticorps monoclonaux, permettant de :
- Vérifier l’intégrité et la conformité des séquences.
- Identifier des modifications post-traductionnelles, comme la glycosylation.
- Garantir la qualité des produits en cours de développement ou de production.
Nos services incluent le séquençage des protéines recombinantes exprimées dans des systèmes comme les cellules CHO. Nous aidons à :
- Valider les séquences obtenues après expression recombinante.
- Détecter les variations ou contaminants.
- Optimiser les étapes de purification et de formulation.
FILAB réalise le séquençage de protéines spécifiques dans des échantillons biologiques pour :
- Identifier des biomarqueurs liés à des pathologies.
- Comparer les protéines dans des matrices saines et pathologiques.
- Faciliter le développement de tests et diagnostics innovants.
Nos analyses de protéine
Analyse de protéine
Applications du séquençage de novo dans l’industrie biopharmaceutique
Le séquençage de novo trouve des applications clés dans divers domaines industriels et scientifiques :
- Identification et caractérisation de protéines thérapeutiques
- Étude des anticorps monoclonaux
- Vérification de la structure primaire des protéines recombinantes
- Découverte de nouvelles protéines : Il permet d’identifier des protéines inconnues, souvent présentes dans des matrices complexes, et contribue ainsi à la recherche fondamentale ou à l’innovation biopharmaceutique.
- Détection de protéines exogènes ou impuretés dans les bioprocédés
- Identification de contaminants dans les lots de production
- Confirmation de la structure primaire des protéines
- Contrôle de l’intégrité des biothérapies
- Analyse des modifications post-traductionnelles : cette méthode identifie des variations structurelles, comme les phosphorylations ou glycosylations, non répertoriées dans les bases de données.
- Études sur des protéines complexes : idéal pour l’analyse de mélanges protéiques issus de matrices biologiques ou environnementales, où les séquences classiques ne suffisent pas.
Ces applications montrent l’importance de cette analyse dans la découverte de biomarqueurs ou le développement de biomédicaments.
Avantages du séquençage de novo
Le séquençage de novo présente des atouts majeurs qui le différencient des approches classiques :
- Indépendance des bases de données : idéal pour explorer des protéines inédites ou peu étudiées.
- Identification précise des variantes : détection des modifications structurelles non prévues ou non documentées.
- Adaptabilité aux matrices complexes : analyse efficace dans des échantillons complexes ou peu purifiés.
Ces avantages en font une méthode incontournable pour les projets d’innovation en biopharmaceutique et en recherche biomédicale.
FAQ
Le séquençage de novo permet de vérifier l’intégrité et la séquence des protéines présentes dans les sérums ou solutions formulées, comme les anticorps monoclonaux. Cela garantit leur conformité aux spécifications thérapeutiques et détecte d’éventuelles modifications structurelles ou impuretés.
Pour les protéines recombinantes, le séquençage de novo identifie précisément la séquence obtenue après expression dans des milieux de culture cellulaire. Il permet également de détecter des variations post-traductionnelles et de vérifier l’absence de contaminants, optimisant ainsi les processus de purification et de production.
Le séquençage de novo des protéines est un outil clé pour la biopharmacie, permettant d’identifier et de caractériser des protéines thérapeutiques sans recourir à une base de données existante. Cette approche est essentielle pour valider l’intégrité structurale des biomédicaments, optimiser le développement de nouvelles molécules et garantir la conformité des produits aux réglementations en vigueur (EMA, FDA).
La caractérisation structurale des protéines sans référence repose sur le séquençage de novo, qui permet d’analyser la structure primaire d’une protéine inconnue ou modifiée. Cette méthode est particulièrement utile pour détecter des variants, identifier des impuretés protéiques et contrôler la pureté des bioproduits, notamment dans les processus de bioproduction et de formulation de biomédicaments.
Le décryptage de la structure primaire des biomolécules est une étape clé du séquençage de novo des protéines, permettant de déterminer la séquence exacte des peptides et de mettre en évidence d’éventuelles modifications post-traductionnelles. Cette analyse est cruciale pour optimiser la stabilité des protéines thérapeutiques, assurer la reproductibilité des lots de production et garantir l’efficacité des traitements biopharmaceutiques.
La spectrométrie de masse en tandem (MS/MS) est indispensable pour identifier des protéines inconnues, contrôler la pureté des biomédicaments et détecter des contaminants. En fragmentant les peptides, elle permet un séquençage précis sans base de données, assurant la conformité et la traçabilité des produits biopharmaceutiques. Confier cette analyse à un laboratoire garantit fiabilité et respect des normes réglementaires.
Le séquençage de novo est essentiel pour caractériser des protéines non répertoriées et analyser des variants, contrairement au peptide fingerprinting, qui se limite aux bases de données existantes. Pour les industriels, cette approche permet un contrôle qualité plus poussé, réduisant les risques et assurant la conformité des biomédicaments. Un laboratoire expert offre précision, équipements de pointe et accompagnement réglementaire.
