Sequençage par nanopore en laboratoire

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Laboratoire accrédité COFRAC ISO 17025

Votre besoin : analyser et comprendre le séquençage par nanopore des ADN et ARN pour optimiser vos processus biopharmaceutiques

Le séquençage par nanopore : une technologie de pointe au service de la biopharmaceutique

Le séquençage par nanopore (Qubit) est une technologie de séquençage de nouvelle génération permettant l’analyse directe et en temps réel de l’ADN et de l’ARN. Dans l’industrie biopharmaceutique, il constitue un outil stratégique pour caractériser, contrôler et sécuriser les biomolécules tout au long de leur cycle de vie.

Au laboratoire filab, le séquençage par nanopore est mis en œuvre pour répondre aux exigences élevées de la biopharmaceutique : fiabilité des données, rapidité d’analyse, interprétation experte et accompagnement technique.

Le principe du séquençage par nanopore

La technologie repose sur le passage d’un brin d’ADN ou d’ARN à travers une nanopore biologique ou synthétique. Chaque nucléotide perturbe de manière spécifique le courant ionique traversant la nanopore.

Ces variations de signal électrique sont enregistrées en continu et traduites en séquence nucléotidique, permettant une lecture longue, sans amplification obligatoire, et une analyse en temps réel.

Les applications du séquençage par nanopore en biopharmaceutique

filab-biopharmaceutique

 

Cette technologie est utilisée dans de nombreux contextes industriels :

  • Caractérisation génétique de biomolécules

  • Contrôle d’identité et d’intégrité de séquences

  • Détection de variants, mutations ou recombinaisons

  • Analyse d’ARN messager (ARNm)

  • Contrôle de vecteurs viraux et plasmidiques

  • Détection de contaminations biologiques

  • Support aux études R&D et développement analytique

  • Étude de stabilité génétique

FILAB réalise le séquençage par nanopore de vos ADN et ARN avec des technologies de pointe

Expertise sur les matrices biopharmaceutiques

ADN/ARN

Le séquençage par nanopore présente des avantages clés pour les industriels du secteur :
Lecture de longues séquences (long reads)
Accès aux modifications épigénétiques (méthylations)
Faible biais analytique (pas ou peu d’amplification)
Flexibilité des applications ADN et ARN
Analyse en temps réel et délais réduits

Quand faire appel au séquençage par nanopore ?

Les industriels sollicitent cette technologie notamment pour :

Sécuriser un développement biopharmaceutique

Comparer des lots ou des lignées

Investiguer une non-conformité génétique

Répondre à une exigence réglementaire

FAQ

Pourquoi choisir le séquençage par nanopore en biopharmaceutique ?

Le séquençage par nanopore se distingue par sa capacité à lire des séquences longues, offrant une vision complète et continue de l’ADN ou de l’ARN analysé. Cette lecture étendue permet d’identifier avec précision des réarrangements, variants complexes ou régions répétées, souvent difficiles à caractériser avec des technologies de séquençage plus conventionnelles.

La technologie permet également une analyse en temps réel. Les données sont générées et exploitables dès le début du séquençage, ce qui réduit significativement les délais d’obtention des résultats et facilite la prise de décision rapide dans un contexte industriel exigeant.

Un autre avantage majeur réside dans l’accès direct aux modifications épigénétiques, comme les méthylations, sans étape de traitement supplémentaire. Cette capacité est particulièrement pertinente pour la caractérisation fine de biomolécules et le suivi de procédés biopharmaceutiques.

Le séquençage par nanopore limite par ailleurs les biais analytiques grâce à une absence, ou une réduction significative, des étapes d’amplification. Les séquences analysées sont ainsi plus représentatives de l’échantillon réel, renforçant la fiabilité et la robustesse des résultats.

Enfin, cette technologie offre une grande flexibilité d’application, aussi bien pour l’analyse de l’ADN que de l’ARN. Elle s’intègre naturellement dans des contextes variés, allant du contrôle qualité au développement analytique, en passant par des projets de R&D et d’innovation.

Ces caractéristiques font du séquençage par nanopore un outil particulièrement adapté aux enjeux de contrôle, de développement et de sécurisation des produits biopharmaceutiques.

Le séquençage par nanopore est-il compatible avec un environnement réglementé ?

Oui. Le séquençage par nanopore peut être mis en œuvre dans un cadre conforme aux exigences réglementaires du secteur biopharmaceutique. Les protocoles sont définis, maîtrisés et documentés, avec une traçabilité complète des échantillons, des paramètres analytiques et des données générées. Les résultats peuvent ainsi être exploités dans des contextes qualité, contrôle ou développement, en cohérence avec les référentiels en vigueur.

Les résultats sont-ils fiables et reproductibles ?

La fiabilité du séquençage par nanopore repose sur la maîtrise de l’ensemble de la chaîne analytique : préparation des échantillons, conditions de séquençage, traitement bio-informatique et interprétation des données. Lorsqu’elle est correctement mise en œuvre, la technologie permet d’obtenir des données robustes, reproductibles et représentatives, y compris pour des séquences longues ou complexes.

Cette technologie est-elle adaptée au contrôle qualité industriel ?

Oui, notamment pour des besoins de contrôle d’identité, d’intégrité de séquences ou d’investigation en cas de non-conformité. Sa rapidité, sa flexibilité et sa capacité à fournir des informations détaillées en font un outil pertinent pour appuyer des décisions qualité dans un environnement industriel.

Les + Filab
Une équipe hautement qualifiée
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Une réactivité de réponse et de traitement des demandes
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Un laboratoire accrédité COFRAC ISO 17025
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(Portées disponibles sur www.cofrac.com - N° accréditation : 1-1793)
Un parc analytique complet de 5 200m²
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